Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb9P20615 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms