Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms