Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntf3P20181 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms