Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms