Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prph2P15499 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prph2P15499 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prph2P15499 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prph2P15499 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms