Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms