Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FosbP13346 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FosbP13346 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FosbP13346 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FosbP13346 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FosbP13346 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FosbP13346 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FosbP13346 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FosbP13346 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FosbP13346 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FosbP13346 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FosbP13346 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FosbP13346 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FosbP13346 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FosbP13346 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FosbP13346 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FosbP13346 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FosbP13346 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FosbP13346 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms