Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms