Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fv4P11370 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fv4P11370 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms