Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P10404 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P10404 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P10404 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P10404 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P10404 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P10404 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P10404 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P10404 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P10404 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P10404 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P10404 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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P10404 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P10404 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P10404 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P10404 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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P10404 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P10404 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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P10404 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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P10404 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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P10404 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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