Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb4P10284 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms