Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd7P0C872 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd7P0C872 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms