Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxc9P09633 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms