Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtrP07309 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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TtrP07309 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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TtrP07309 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TtrP07309 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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TtrP07309 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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TtrP07309 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TtrP07309 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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