Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9P06683 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9P06683 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9P06683 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9P06683 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9P06683 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9P06683 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9P06683 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9P06683 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9P06683 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9P06683 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9P06683 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms