Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb1P04202 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tgfb1P04202 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tgfb1P04202 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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