Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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