Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01852 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01852 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01852 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01852 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01852 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01852 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01852 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms