Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01735 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01735 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01735 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01735 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01735 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01735 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01735 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01735 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01735 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01735 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01735 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01735 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01735 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01735 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01735 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01735 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01735 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms