Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01638 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01638 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01638 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01638 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01638 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01638 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01638 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms