Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcn2O88968 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms