Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JtbO88824 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JtbO88824 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JtbO88824 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JtbO88824 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JtbO88824 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JtbO88824 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JtbO88824 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JtbO88824 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JtbO88824 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JtbO88824 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JtbO88824 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JtbO88824 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JtbO88824 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms