Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcn3O88705 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms