Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops6O88545 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cops6O88545 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops6O88545 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops6O88545 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms