Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops4O88544 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops4O88544 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms