Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme6O88425 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms