Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nid2O88322 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid2O88322 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms