Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms