Protein–RNA interactions for Protein: O70405

Ulk1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk1O70405 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk1O70405 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk1O70405 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms