Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChkbO55229 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms