Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr1O55100 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms