Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3O54890 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms