Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffbO54788 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DffbO54788 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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