Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Timm44O35857 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Timm44O35857 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Timm44O35857 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm44O35857 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms