Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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