Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms