Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd2O35392 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxd2O35392 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms