Protein–RNA interactions for Protein: O35386

Phyh, Phytanoyl-CoA dioxygenase, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhyhO35386 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PhyhO35386 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PhyhO35386 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PhyhO35386 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PhyhO35386 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PhyhO35386 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PhyhO35386 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PhyhO35386 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PhyhO35386 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PhyhO35386 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PhyhO35386 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PhyhO35386 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PhyhO35386 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PhyhO35386 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PhyhO35386 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PhyhO35386 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms