Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms