Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkd2O35245 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms