Protein–RNA interactions for Protein: O35207

Cdk2ap1, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap1O35207 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cdk2ap1O35207 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cdk2ap1O35207 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cdk2ap1O35207 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cdk2ap1O35207 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cdk2ap1O35207 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cdk2ap1O35207 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cdk2ap1O35207 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk2ap1O35207 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms