Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms