Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EllO08856 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EllO08856 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EllO08856 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EllO08856 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms