Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltaO08585 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltaO08585 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltaO08585 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltaO08585 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltaO08585 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltaO08585 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltaO08585 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltaO08585 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltaO08585 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltaO08585 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltaO08585 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CltaO08585 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltaO08585 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltaO08585 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltaO08585 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltaO08585 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltaO08585 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltaO08585 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltaO08585 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltaO08585 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltaO08585 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltaO08585 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltaO08585 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltaO08585 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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