Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm8857L7N291 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm8857L7N291 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm8857L7N291 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm8857L7N291 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm8857L7N291 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm8857L7N291 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm8857L7N291 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm8857L7N291 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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