Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms