Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms