Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm21797J3QNW5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm21797J3QNW5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm21797J3QNW5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm21797J3QNW5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm21797J3QNW5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm21797J3QNW5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm21797J3QNW5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm21797J3QNW5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm21797J3QNW5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm21797J3QNW5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21797J3QNW5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm21797J3QNW5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm21797J3QNW5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm21797J3QNW5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21797J3QNW5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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