Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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