Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21972J3QN38 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21972J3QN38 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21972J3QN38 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms